同じ質問が多いので、参考にしてください。

[現象]

仮想デスクトップ上のIEで以下のURLを表示すると、Webブラウザがチラツクといった現象が発生しました。

[解決方法]

 マイクロソフト社の技術情報に次のものがございますので、参考にしていただければと存じます。

ターミナル サービス クライアント セッションで、アニメーション コンテンツを
含む Web ページを Internet Explorer で表示すると画面がちらつくことがある
 http://support.microsoft.com/kb/271246\\

個人的には、他に回避策がないのか?と思ったりもしますが、

さらに個人的にActiveXが。。。なもので

NSのPlugin派でした、、、すみません。

Is that using .net 3.5 wpa extensions? - Not sure for me…